Sa mission est exprimée dans le règlement organique de l’Université de Kinshasa. Ce règlement, comme tout autre, est général. Il émet un principe qui s’applique à l’ensemble des douze Facultés de l’Université de Kinshasa. Ainsi la substance de la mission des facultés repose sur le triplet : assurer l’enseignement, assurer la recherche et rendre service à la communauté. Pour marquer la spécificité de la Faculté de Médecine, le Décanat a élaboré un texte plus explicite écrit de la manière suivante :
La Faculté de Médecine affirme offrir à la société des médecins capables de diagnostiquer et de traiter toutes les maladies et d’identifier tous les problèmes de santé publique et d’y apporter des répliques adaptées, dans le respect des valeurs universelles et des valeurs propres à la société congolaise.
De même, elle s’applique en matière de recherche à la résolution des problèmes de la communauté. Elle garantit les soins complets grâce aux techniques biomédicales modernes à travers ses hôpitaux et son école de Santé Publique.
Ce texte, inspiré d’autres, traduit la volonté du Décanat à cristalliser les aspirations de progrès contenues dans l’exposé de sa mission.